Berdasarkan Peraturan Gubernur DIY Nomor 71 Tahun 2022, Kabupaten Bantul memiliki 19 (sembilan belas) geodiversity site, diantaranya adalah sebagai berikut :
Sendang Gingglangjati Surocolo, di Kalurahan Seloharjo, Kapanewon Pundong, Kabupaten Bantul;
Tanggul Pantai Srigading-Samas, di Kalurahan Srigading, Kapanewon Sanden, Kabupaten Bantul;
Lahan Basah Gilangharjo, di Kalurahan Gilangharjo, Kapanewon Pandak, Kabupaten Bantul;
Gunung Wangi, di Kalurahan Srimulyo, Kapanewon Piyungan, Kabupaten Bantul;
Kali Plumpatan, di Kalurahan Srimartani, Kapanewon Piyungan, Kabupaten Bantul;
Bukit Tompak, di Kalurahan Srimulyo, Kapanewon Piyungan, Kabupaten Bantul;
Puncak Bucu, di Kalurahan Sitimulyo, Kapanewon Piyungan, Kabupaten Bantul;
Grojogan Tuwondo, di Kalurahan Sitimulyo, Kapanewon Piyungan, Kabupaten Bantul;
Goa Selarong, di Kalurahan Guwosari, Kapanewon Pajangan, Kabupaten Bantul;
Air Terjun Curug Banyunibo, di Kalurahan Sendangsari, Kapanewon Pajangan, Kabupaten Bantul;
Gunung Purba Sewu Watu, di Kalurahan Wukirsari, Kapanewon Imogiri, Kabupaten Bantul;
Watu Ngelak, di Kalurahan Trimulyo, Kapanewon Jetis, Kabupaten Bantul;
Goa Gajah, di Kalurahan Mangunan, Kapanewon Dlingo, Kabupaten Bantul;
Kedung Tolok, di Kalurahan Selopamioro, Kapanewon Imogiri, Kabupaten Bantul;
Goa Cerme, di Kalurahan Selopamioro, Kapanewon Imogiri, Kabupaten Bantul;
Watu Lawang-Srikeminut, di Kalurahan Sriharjo, Kapanewon Imogiri-Kalurahan Mangunan, Kapanewon Dlingo, Kabupaten Bantul;
Lemah Rubuh, di Kalurahan Selopamioro,Kapanewon Imogiri, Kabupaten Bantul; dan
Karst Tubing, di Kalurahan Argomulyo,Kapanewon Sedayu, Kabupaten Bantul;
Watu Kapal, di Kalurahan Srimulyo, Kapanewon Piyungan, Kabupaten Bantul-Kalurahan Tegaltirto, Kapanewon Berbah, Kabupaten Sleman.